Nationaal Groenfonds is een stichting met een bestuur, waarvan de leden benoemd worden door het ministerie van EL&I en de provincies. Daarnaast stellen het ministerie en de provincies ieder een waarnemer aan, die namens EL&I en IPO de bestuursvergaderingen bijwonen.
Bestuur
professor mr. Pieter van Vollenhoven, voorzitter
ir. P.O. (Pim) Vermeulen, penningmeester
professor dr. J.J. (Jaap) van Duijn
mr. G.J. (Geert) Jansen
mr. T.H.J. (Tjibbe) Joustra
ir. P.H. (Peter) Vogtländer †
Waarnemers
drs. R.P. (Rob) van Brouwershaven, namens het ministerie van EL&I
drs. G. (Gerard) Beukema, namens het Interprovinciaal Overleg
Directeur
mr. W.J. (Walter) Kooy
Organisatie en dagelijkse bedrijfsvoering
Nationaal Groenfonds heeft de organisatie en dagelijkse bedrijfsvoering ondergebracht bij
Fondsenbeheer Nederland te Hoevelaken. Dankzij deze organisatievorm worden belangrijke synergie voordelen behaald. De personele inzet voor Nationaal Groenfonds kan daardoor beperkt blijven (11,9 FTE). In het
Organogram (ppt) staat beschreven hoe de organisatie van Nationaal Groenfonds binnen Fondsenbeheer is geregeld.